服务介绍
定点突变是指在DNA分子的特定位置上发生的单个碱基的变化,通常指有意识地通过基因工程方法改变DNA序列的某一位点,从而产生特定的基因型和表型变化。这种技术在生命科学研究、医学治疗和农业生产等领域都有着广泛的应用。通过定点突变技术,可以产生具有特定性状或功能的基因型,如疾病模型、抗病性、耐盐碱性等。定点突变技术的出现为生命科学领域提供了一种精准而高效的基因工程方法,可以为研究人员提供更多的实验手段和研究工具。
服务优势
- 序列准确性:高性能GS聚合酶可确保突变体的准确性,避免产生不需要的突变。
- 任意位点:使用我们先进的基因合成和突变技术,金开瑞可在任何位点引入突变。
- 较长DNA上进行突变:经过技术优化提升,可在长达12 kb的DNA(包括目标基因及其载体)上引入点突变、插入突变和缺失突变。
- 一站式解决方案:我们提供全面的上下游服务,包括模板DNA测序、基因合成、快速克隆到自由表达载体、定制载体构建以及蛋白质表达和纯化。
服务流程
客户提供
1.客户提供模板突变前基因序列,及突变后基因序列,并标注突变位置;
2.目的序列需要插入的载体信息,包括序列,抗性,测序引物,克隆位点;
3.样品:
1)包含目的序列的模板质粒,模板质粒的抗性;
2)目的载体(金开瑞无法提供载体情况下);
4.模板质粒中包含目的基因序列这段的峰图格式测序报告(并非整个模板质粒的测序报告)。
最终交付
- 约4 µg含有目的片段的高纯度冻干质粒DNA;
- 含有重组质粒的穿刺菌或甘油菌一管(默认菌株为TOP10具体以样品管壁标签为准。);
- 发货文件主要包括如下内容:测序结果、COA报告、sqd文件、seq文件。
服务说明
服务名称 | 服务周期(工作日) | 备注 |
基因长度<1500bp | 5-8 | 模板序列有难度需要另外评估 |
1500bp≤基因长度<3000bp | 8-13 | 模板序列有难度需要另外评估 |
3000bp≤基因长度 | 请咨询 | 模板序列有难度需要另外评估 |
相关资源
1、怎么优化定点突变实验条件,例如反应温度、引物浓度、聚合酶的选择等
①反应温度优化:
● 温度梯度法:在一定温度范围内设置多个反应管,每个管中温度略有不同,进行反应并比较扩增效果。根据结果确定最适合的温度。
● 温度逐步优化法:逐步调整反应温度,开始时选择一个常用的温度,根据结果逐渐提高或降低温度,找到最优温度。
②引物浓度优化:
● 引物浓度梯度法:在一定浓度范围内设置多个反应管,每个管中引物浓度略有不同,进行反应并比较扩增效果。根据结果确定最适合的引物浓度。
● 引物浓度逐步优化法:逐步调整引物浓度,开始时选择一个常用的浓度,根据结果逐渐增加或减少引物浓度,找到最优浓度。
③聚合酶的选择和浓度优化:
● 聚合酶比较实验:同时使用不同聚合酶进行反应,比较扩增效果和特异性。根据结果选择最适合的聚合酶。
● 聚合酶浓度优化:在一定浓度范围内设置多个反应管,每个管中聚合酶浓度略有不同,进行反应并比较扩增效果。根据结果确定最适合的聚合酶浓度。
④反应时间优化:
● 反应时间梯度法:在一定时间范围内设置多个反应管,每个管中反应时间略有不同,进行反应并比较扩增效果。根据结果确定最适合的反应时间。
● 反应时间逐步优化法:逐步调整反应时间,开始时选择一个常用的时间,根据结果逐渐增加或减少反应时间,找到最优时间。
2、怎么防止偶发突变,提高定点突变实验的特异性和准确性
● 引物设计优化:确保引物的设计准确和特异性,避免引物之间的相互作用或自身的二级结构形成。选择合适的引物长度和序列,使用专业的引物设计工具进行引物设计,如Primer3、IDT OligoAnalyzer等,以提高引物的特异性和效率。
● 引物和模板的纯化:使用纯度高的引物和模板可以减少非特异性扩增和偶发突变的发生。使用纯化试剂盒或纯化方法对引物和模板进行纯化,去除杂质和不特异的序列,提高突变实验的可靠性。
● 聚合酶的选择:选择高保真度的聚合酶,具有较低的错误率和较好的扩增能力。高保真度的聚合酶可以降低错误率,减少偶发突变的可能性。
● 优化反应条件:调整反应条件可以减少偶发突变的发生。优化反应温度、引物浓度、聚合酶的选择和浓度、反应时间等参数,以提高反应的特异性和效率。通过尝试不同的温度梯度、引物浓度梯度和聚合酶浓度梯度等,找到最适合的反应条件。
● 实验验证和重复:进行实验验证和重复是防止偶发突变的重要步骤。使用阴性对照组和阳性对照组验证突变位点的正确性和特异性。重复实验可以评估实验的稳定性和可重复性,排除偶发突变的影响。
● 严格的实验操作:遵循实验室的操作规范和流程,保持实验室的清洁和卫生,避免污染和误操作的发生。使用新鲜的试剂和消耗品,避免交叉污染。
● 数据分析和解释:对实验结果进行准确的数据分析和解释,确认突变位点的正确性和特异性。使用合适的测序方法进行突变位点的鉴定和验证,结合基因组浏览器等工具进行数据分析和解读。
3、如何检测定点突变效率?
检测方法 |
特点 |
限制 |
适用场景 |
测序分析 |
直接获取突变位点的序列信息, 能确定具体的碱基改变 |
需要进行测序,可能存在测序误差, 无法检测大规模突变 |
定点突变鉴定、序列验证、突变频率分析 |
限制性内切酶切割 |
利用酶切产物的大小和模式来判断突变是否发生, 直观观察突变效果 |
仅适用于改变限制性内切酶切割位点的突变, 其他类型的突变不适用 |
突变位点酶切验证、突变筛选 |
PCR分析 |
通过扩增突变片段进行检测, 可进行大规模突变筛选 |
PCR扩增过程中可能存在非特异性扩增、 扩增效率差异等问题, 需优化引物和反应条件 |
大规模突变筛选、突变频率分析、突变鉴定 |
克隆和测序 |
通过克隆突变片段到载体并测序, 获得多个克隆子的突变信息 |
需要进行克隆和测序步骤,相对耗时和费力 | 克隆突变验证、多克隆体突变分析、突变效率评估 |
功能性分析 |
通过评估突变对蛋白质功能或 生物学活性的影响来判断突变效果 |
针对具体功能进行分析, 可能需要进一步实验或检测手段 |
突变功能评估、蛋白质功能解析、功能位点鉴定 |
这些方法在定点突变实验中各具特点和适用场景,可以根据实验的目的和需求选择合适的检测方法。同时,综合使用多种方法可以提高突变效率的准确性和可靠性,并进一步解析突变对蛋白质功能或生物学活性的影响。