lncRNA生物素探针制备实验方法
lncRNA是长链非编码RNA,具有重要的调控功能。生物素探针制备是用于检测lncRNA的常用实验方法。以下是lncRNA生物素探针制备的实验方法:
材料:
化学合成lncRNA序列
生物素标记试剂
生物素-streptavidin结合酶
Purification Streptavidin Magnetic Beads
Tris-buffered saline (TBS) buffer
Isopropanol
RNase-free water
100% ethanol
真空泵
离心管
磁珠分离架
热冷循环仪
碱性磷酸缓冲液(PBS)
步骤:
合成lncRNA序列:根据目标lncRNA的序列设计并合成相应的lncRNA序列。
生物素标记:将合成的lncRNA序列和生物素标记试剂进行反应,标记lncRNA序列上生物素基团。
纯化标记的lncRNA:将反应产物通过Purification Streptavidin Magnetic Beads进行纯化,将标记的lncRNA分离和纯化出来。
脱生物素标记的lncRNA:通过在酸性条件下和生物素- streptavidin结合酶的作用,将lncRNA与生物素结合的连接打断,获得脱生物素标记的lncRNA。
纯化脱生物素标记的lncRNA:通过磁珠分离架和真空泵的作用,将脱生物素标记的lncRNA从反应混合物中进行纯化。
水解lncRNA:通过加入RNase-free water和碱性磷酸缓冲液,将lncRNA水解为大分子RNA。
纯化lncRNA探针:通过加入等体积的异丙醇和100% 乙醇,然后通过离心的方式将最终的lncRNA探针从反应混合物中进行纯化。
最终产物检测:使用热冷循环仪等设备进行PCR扩增,验证生物素探针制备的效果。
以上就是lncRNA生物素探针制备的实验方法。