服务介绍
基因合成是指利用化学方法将一段完整的DNA序列合成成一条完整的DNA分子的过程,通常通过连接短的寡核苷酸序列逐步合成长链DNA。基因合成技术可以根据需求设计合成包括蛋白质编码序列、RNA干扰分子、基因表达调控元件等各种功能元件。这项技术在现代生命科学、医学研究、生物制药等领域都有着广泛的应用,可以为研究人员提供一种快速、高效的合成DNA分子的方法,为基因工程和基因组学研究提供了有力支持。
服务优势
- 自主研发的超长识别序列核酸内切酶能精确切割双链DNA,且酶切位点可以根据要求定制,可用于基因大片段的组装,为合成生物学又添一件利刃。
- 自主研发的超低反应温度多段重组酶,反应、转化均可在冰上进行,真正实现“One Step”。
- 新技术工艺更稳定,周期更短,价格更实惠。
服务流程
客户提供
基因序列或蛋白质氨基酸序列
最终交付
- 约4 µg含有目的片段的高纯度冻干质粒DNA;
- 含有重组质粒的穿刺菌或甘油菌一管(默认菌株为TOP10具体以样品管壁标签为准);
- 发货文件主要包括如下内容:测序结果、COA报告、sqd文件、seq文件。
服务说明
服务内容 | 基因长度 | 周期 |
基因合成 |
0~1kb |
7 |
1kb~2kb | 8-13 | |
2kb~3kb | 12-17 | |
3kb~4kb | 16-20 | |
4kb~5kb | 20-25 | |
5kb~6kb | 25-30 | |
大于6kb | 咨询 |
案例展示
相关资源
1、基因合成实验中涉及到的一些专属名词及释义
● 寡核苷酸:由较少数量的核苷酸单元组成的短链,常用作DNA合成过程中的引物。
● 固相合成:一种常用的DNA合成方法,其中DNA链在固相材料(通常是小颗粒)上逐渐构建,通过逐步添加单个核苷酸单元来进行。
● PCR(聚合酶链式反应):一种常用的DNA复制技术,通过不断循环的变温步骤,在体外扩增和复制目标DNA序列。
● 载体:用于将合成的DNA序列转移到细胞中的DNA分子。常见的载体包括质粒、病毒或合成的DNA片段。
● 克隆:将DNA插入到载体中的过程,形成克隆DNA。克隆可用于扩增、保存和研究特定的DNA序列。
2、涉及基因合成的实验举例
实验类型 |
使用基因合成的应用 |
合成可变区域(variable region)或全长重链和轻链的基因序列,以构建定制的抗体。 | |
双荧光素酶报告基因实验 |
构建包含双荧光素酶基因的报告基因载体,用于监测目标基因的表达水平和调控机制。 |
RNA干扰(RNAi)实验 |
合成小干扰RNA(siRNA)或小核苷酸发夹(shRNA),以抑制目标基因的表达。 |
CRISPR-Cas9基因编辑实验 |
合成CRISPR RNA(crRNA)和转录单元(tracrRNA),用于导向Cas9蛋白靶向基因组中的特定位点,实现基因编辑和修饰。 |
蛋白质标记实验 |
构建带有特定标签序列的蛋白质表达载体,用于蛋白质的纯化、定位和可视化,如融合标签(如His标签、GST标签)或荧光标签(如GFP标签)等。 |
克隆和表达实验 |
合成目标基因的DNA序列,并将其插入表达载体中,以实现目标基因的表达和产生特定蛋白质。 |
DNA纳米技术实验 |
利用基因合成构建DNA纳米结构和纳米器件,用于生物传感、药物传递、分子计算等应用。 |
基因组重编程实验 |
合成和设计基因组的改造,以研究基因组的功能、调控和重编程。 |
3、基因合成中用于设计、分析和操作合成的工具简介
工具 |
功能 |
ApE (A plasmid Editor) |
用于DNA序列编辑和分析的免费软件,可以进行序列标记、限制酶切位点分析、引物设计等。 |
SnapGene |
用于DNA序列设计、分析和模拟的商业软件,提供直观的界面和许多实用功能,如序列编辑、PCR模拟、蛋白质序列注释等。 |
Vector NTI |
商业软件套件,用于DNA序列设计、分析和操作。它提供了多种工具,包括序列比对、引物设计、限制酶切位点分析等 |
Serial Cloner |
免费的DNA序列编辑和分析软件,提供基本的序列操作和分析功能,如序列标记、PCR引物设计、限制酶切位点分析等。 |
Primer3 |
用于设计PCR引物的广泛使用的免费在线工具,根据给定的参数和目标序列自动设计引物。 |
OligoAnalyzer |
用于评估DNA或RNA序列的理化特性和引物设计的免费在线工具。可以预测引物的熔解温度、GC含量、二级结构和互补性等参数。 |
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) |
用于序列比对和相似性搜索的免费在线工具,可以在数据库中搜索与给定序列相似的序列。 |
EMBOSS (European Molecular Biology Open Software Suite) |
提供一系列免费的生物信息学工具,用于DNA序列分析,如ORF预测、限制酶切位点分析、序列比对等。 |
UCSC Genome Browser |
提供基因组序列和注释的在线浏览器,可以检索和分析各种物种的基因组信息。 |
Benchling |
商业化实验室操作平台,用于设计、分析和操作DNA序列。提供了多种实用功能,如序列编辑、引物设计、限制酶切位点分析、克隆等。 |
4、基因合成失败及原因分析
①合成产物不存在/未扩增成功:
● 引物设计问题:引物序列选择不当,导致与目标序列不特异结合。
● 引物合成问题:引物质量不佳,包括错配、缺失或杂质。
● PCR条件问题:PCR反应条件不正确,如温度、时间和酶浓度等。
②扩增产物存在杂交/非特异性扩增:
● 引物设计问题:引物与其他非目标序列存在非特异性结合。
● 目标序列复杂性问题:目标序列具有高度变异性或复杂结构,导致引物无法特异性结合。
③扩增产物存在多个带或模糊带:
● 引物设计问题:引物选择不当,导致非特异性扩增或引物间的非特异性结合。
● 目标序列问题:目标序列存在拷贝数变异或基因组重复区域,导致扩增产物不明确或杂交特异性差。
④扩增产物偏低/低效:
● 引物设计问题:引物长度不合适或GC含量偏高或偏低,影响引物的特异性和扩增效率。
● PCR条件问题:PCR反应条件不适当,如温度、时间和酶浓度等。
● 目标序列问题:目标序列可能具有复杂结构或高度变异性,使扩增困难。
⑤引物降解或污染:
● 引物贮存问题:引物储存条件不当,如暴露在高温或湿度环境下,导致引物的降解和损坏。
● 污染问题:实验操作中引物、试剂或反应管的污染,影响扩增结果。