实验原理
RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具。该技术主要是运⽤目标蛋⽩的特异性抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化对结合在复合物上的RNA进行q-PCR验证或者高通量测序分析。
实验流程
试剂盒组分
常见问题与解答
Q1:如何判断RIP实验成功?
RIP后WB检测IP组和input组检测到目的蛋白信号即判断RIP实验成功。
Q2:IP和IgG样本Ct值没有差异
多方面原因造成:
1.抗体没有富集到RNA,可更换抗体尝试;
2.IgG背景过高,可增加洗涤次数或减少免疫沉淀步骤RNA投入量。
Q3:溶解曲线异常
出现非特异扩增或有引物二聚体等情况,需重新设计引物。
Q4:拉下样本RNA浓度过低
1.样本投入量过少,考虑增加样本初始投入量。
2.裂解不完全,组织样本未研磨充分,或者用强裂解液进行裂解。
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