知无不“研”| PCR超全实验操作视频及实例protocol(视频+直播,实验从入门到精通)
信息来源:金开瑞 作者:genecreate 发布时间:2020-07-24 09:13:17
近日,2019 年全国青少年科技创新大赛的一项获奖作品引发人们关注。这位获奖同学在实验记录中写到:2018.1.13 了解PCR技术的原理,知道PCR引物的设计......
(图片来源于https://www.sohu.com/a/407591540_600553?_trans_=000014_bdss_dklzxbpcgP3p:CP=)
那究竟什么是PCR?PCR的实验原理是什么?PCR实验怎么做?莫慌!请听小编一 一为大家解答~
PCR简介
PCR (Polymerase Chain Reaction),中文翻译为聚合酶链式反应,是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊DNA复制。由1983年美国Mullis首先提出设想,1985年由其发明了聚合酶链反应,即简易DNA扩增法,意味着PCR技术的真正诞生。到如今,PCR技术已广泛应用于生命科学、医学研究、遗传工程、法医学、考古学、人类学等领域。
实验流程举例说明
01 扩增样本数据分析
02 PCR扩增需准备的试剂
03 PCR扩增需准备的仪器
PCR仪
04 PCR扩增需要的程序
扩增样品主要有两个参数需要注意,一个是退火温度,一个是延伸时间,退火温度是根据GC含量决定的,通过软件分析,它的GC含量属于正常水平,所以我们设置56°。延伸时间是由扩增基因片段长度决定的,我们所使用的扩增酶pfu酶理论上每分钟可以扩增2000bp,扩增的样品大小大概660bp左右,所以设置30s应该是足够了。
05 PCR反应后,点胶检测其大小,待回收大小正确的目的片段
06 结果展示与分析
07 常见问题与解答
1、Q: 不出现扩增条带?
A: 在酶和引物质量好时,不出现扩增带,极有可能是标本的消化处理,模板核酸提取过程出了毛病。例如,模板中含有杂蛋白质,在提取制备模板时丢失过多,或吸入酚。因而要配制有效而稳定的消化处理液,其程序亦不宜随意更改。
2、Q: 出现的PCR扩增条带与目的靶序列条带一致,但其条带更整齐,亮度更高(假阳性)?
A: 出现假阳性的原因有:①引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,在进行PCR扩增时,扩增出的PCR产物为非目的性的序列。因此,需重新设计引物。②靶序列或扩增产物的交叉污染。这种假阳性可用以下方法解决:操作时应小心轻柔,防止将靶序列吸入加样枪内或溅出离心管外。除酶及不能耐高温的物质外,所有试剂或器材均应高压消毒。所用离心管及枪头等均应一次性使用。
3、Q: 出现非特异性扩增条带?
A: 非特异性条带的出现,其原因:一是引物与靶序列不完全互补、或引物聚合形成二聚体。二是Mg2+离子浓度过高、退火温度过低及PCR循环次数过多有关。三是酶的质和量,酶量过多有时也会出现非特异性扩增。其对策有:必要时重新设计引物。减低酶量或调换另一来源的酶。降低引物量,适当增加模板量,减少循环次数。
4、Q: 出现片状拖带或涂抹带?
A: 其原因往往由于酶量过多或酶的质量差,dNTP浓度过高,Mg2+浓度过高,退火温度过低,循环次数过多引起。其对策有:①减少酶量,或调换另一来源的酶。②减少dNTP的浓度,适当降低Mg2+浓度。③增加模板量,减少循环次数。
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