知无不“研”|5篇高分文献带你一览高通量酵母杂交的非凡魅力~
酵母转录因子Gal4包含DNA结合结构域(Gal4-BD)和转录激活域(Gal4-AD),诱饵(prey)与Gal4-BD融合,猎物(bait)蛋白与Gal4-AD融合,当诱饵和猎物发⽣相互作用时,Gal4-BD和Gal4-AD在空间上充分接近,可呈现完整的GAL4转录因子活性,启动激活报告基因AUR1-C、ADE2、HIS3和MEL1的转录。
高通量酵母杂交技术,作为酵母双杂交技术与高通量技术的融合,已经在生物科学研究中发挥了重要的作用。研究者可以在相对短的时间内,对数以万计的蛋白质对进行大规模的筛选和鉴定,从而得到丰富的蛋白质相互作用图谱。至今,科研人员已经运用这项技术发表了许多高水平文章,其中不乏许多经典的高分文献,我们一起来看看~
01 Nature:人类蛋白质二元互作组参考图谱——HuRI诞生!
这篇文章由来自Dana-Farber癌症研究所、哈佛大学医学院、多伦多大学等多家单位超80名研究人员,跨越了近十年的努力,共同合作完成。该研究通过约30亿次酵母双杂交实验检测了人体内53,000余种二元蛋白相互作用,涉及超过8,000种蛋白质,并成功绘制迄今为止最大规模的人类蛋白质互作组图谱(human binary protein interactome, HuRI)。
(图源:10.1038/s41586-020-2188-x)
02 Nat Cell Biol:一种综合的秀丽隐杆线虫细胞极性蛋白之间的二元相互作用和表型图谱
细胞极性的建立是多细胞生物发育以及细胞和组织功能发挥所必需的基本过程。本研究使用酵母双杂交技术,结合表型分析,构建了一个关于秀丽隐杆虫细胞极性建立和维持的蛋白质相互作用网络。该网络提供了大量候选相互作用,有助于进一步深入了解细胞极性的机制。
图1C用于建立秀丽隐杆线虫细胞极性相互作用网络的酵母双杂交筛选和计算验证流程概述
(图源:doi:10.1038/ncb3300)
03 Nature Biotechnology:一种SARS-cov-2病毒与人源蛋白之间的综合互作网络揭示COVID-19的病理生物学和潜在宿主治疗靶点
研究病毒与宿主之间的蛋白质-蛋白质相互作用有助于发现治疗病毒感染的方法。本研究利用酵母双杂交和质谱技术,构建了SARS-CoV-2与宿主的蛋白质互作网络,发现了新的病毒与宿主互作关系,并通过药物筛选确定了可能对COVID-19有治疗作用的候选药物。这些发现有助于深入了解病毒与宿主相互作用机制,并为药物研发提供了新方向。
(图源:https://doi.org/10.1038/s41587-022-01474-0)
04 Nature Communications:黑腹果蝇下一代大规模二元蛋白相互作用网络
研究团队通过酵母双杂交技术,构建了涵盖数千种蛋白质相互作用的果蝇蛋白相互作用网络。这个网络有助于识别新的生物学路径和过程组件,并为研究蛋白质功能和疾病建模提供了宝贵的数据资源。特别是对自噬网络的研究揭示了deformed wings(dwg)基因编码蛋白的双重角色,为理解蛋白质网络和功能提供了新的视角。
图1A系统筛选流程的示意图
(图源:https://doi.org/10.1038/s41467-023-37876-0)
05 Nature Communications:柑橘黄龙病病原体CLas的蛋白质互作网络
该文章对柑橘黄龙病病原体CLas的蛋白质相互作用的研究进行了描述。通过使用酵母双杂交系统,作者确定了CLas中542个蛋白质之间共计4245个相互作用关系,从而揭示了其潜在功能。这些发现为理解CLas的生物学和致病机制提供了新的见解,并为进一步的研究提供了宝贵的资源。
(图源:https://doi.org/10.1038/s41467-023-43648-7)
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参考文献:
doi:10.1038/ncb3300.
https://doi.org/10.1038/s41587-022-01474-0
https://doi.org/10.1038/s41467-023-37876-0
https://doi.org/10.1038/s41467-023-43648-7
doi:10.1038/s41586-020-2188-x
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