看文章和做实验怎么选择

        我们在设计课题、写标书的时候，常常遇到这样的问题：找到了一个新的分子，这个分子是在疾病组（或者实验组）高表达，而且通过细胞和动物实验证明了它的功能，在做机制的时候常遇到的问题是：为什么这个分子是高（低）表达的？也就是该分子表达异常的上游机制。

 

        关于这一点，我们在前面以lncRNA为例介绍了很多机制，总体来说可以分为转录水平、转录后水平，甚至是蛋白翻译水平（这一点包括在转录后水平），这是整个框架，大家在考虑的时候一定要有这种整体概念，不要被局部的研究主题（比如microRNA）所限制，否则一旦一个主题做不出来，就很容易遇到困境，本来科研就有风险，一条路走不通我们可以考虑其他的路，不要在一棵树上吊死，条条大路通课题嘛！

 

        展开来说，组蛋白修饰、转录因子、DNA的甲基化修饰、基因的拷贝数变异等等，这些都是影响分子表达的转录水平的因素；可变剪接、RNA降解（比如microRNA介导）、RNA翻译等等这些是在转录后发生的RNA水平的影响分子表达的因素；当蛋白被翻译出来以后，蛋白会被修饰（比如磷酸化）从而影响活性，被折叠（如果折叠异常，蛋白不能形成正常的构象，也会影响到功能），当然，按照我们前面对分子机制的归类，活性和表达分属不同机制，还有就是蛋白的降解，比如我们以前说过的蛋白的泛素化途径降解；

 

        因此，理论上说，当我们在研究蛋白异常表达的机制时，我们需要考虑这么多因素，比如我们首先需要对这么多因素进行检测，比如在10个可能性里面有三个可能性（比如蛋白的低表达可能同时由于基因被转录因子抑制、microRNA抑制mRNA翻译和蛋白被泛素化降解所导致的），那么我们选择一个方向或者几个方向做就可以了，当然，如果我们可以多做几个，研究发表的文章分数会更高，比如我们介绍过的一篇nature（（文章篇）S5E23: 研究microRNA发Nature的策略及延伸），对microRNA分子let7的异常低表达就是做出了三个因素；对课题申请来说，一个面上项目要求的复杂性也可以通过这种多因素来解决。

 

        当然，除了上游的分子机制外，下游的机制也可以同样这么来思考，换个位置而已。

 

        说了这么些，主要想说的意思是，大家在做课题的时候一定要有这种理论支撑，尽量能从全局的角度来考虑课题。做实验很重要，看文章也同样重要，文章看好了真的是能少走很多弯路，也经常有新的思路出来。