亚细胞蛋白质组学

信息来源:金开瑞 作者:genecreate 发布时间:2019-05-10 14:01:22

       亚细胞蛋白质组学(subcellular proteomics)是针对细胞内不同区域结构功能单位的蛋白质组学研究,可以减少全细胞蛋白组分析的复杂性。对亚细胞结构进行功能分析,将定量技术和差异分析引入亚细胞蛋白质组学,来观察亚细胞结构的蛋白质组在某些生理或病理条件下的变化,可加深对细胞生理分子机制和亚细胞组分结构功能的理解。
       武汉金开瑞结合多年蛋白组学研究经验,已成功实现对多个亚细胞器组分的定性和定量分析,包括膜蛋白质组、叶绿体蛋白质组、线粒体蛋白质组等。
 
膜蛋白质组
  • 膜蛋白质组
真核生物中,细胞质膜 (plasma membrane) 与细胞内膜统称为生物膜 。生物膜最基本的作用是维持细胞内微环境的相对稳定,并与外界环境不断地进行物质交换、能量和信息的传递。与细胞起源、细胞分裂分化、细胞识别免疫、物质运输、信息传递、代谢调控、能量转换神经传导以及肿瘤的发生均有关。
膜蛋白的功能异常与多种疾病直接相关,其中50%是目前已知药物的作用靶点。膜蛋白质组学研究可用于寻找疾病标志物,筛选药物作用靶点等。
  • 叶绿体蛋白质组
叶绿体是植物和绿藻的特征细胞器,是植物进行光合作用的主要场所,是除细胞核外存在遗传物质的细胞器之一。据估计高等植物共有约21000-25000个蛋白质,其中叶绿体的蛋白质占10%-20%。
利用蛋白组学技术全面了解植物叶绿体的生物发生、结构功能及其对不同环境的光合响应调节机制,明确叶绿体不同膜区和膜间隔微区定位的亚蛋白质组信息,将有望在揭示植物叶绿体适应环境变化的调节机制以及阐明叶绿体在植物生长发育及代谢调控等生命活动中的规律等方面有新突破。
  • 线粒体蛋白质组
线粒体是细胞能量代谢、生物合成和细胞死亡的调控中心,其蛋白结构和功能的改变会导致许多疾病的产生。线粒体蛋白质组学研究可为解析线粒体的生理功能、探索线粒体相关疾病的发病机制及促进线粒体为靶向的药物研发提供重要理论依据。
线粒体是真核细胞重要的细胞器,是细胞能量代谢、生物合成和细胞死亡的调控中心,其蛋白结构和功能的改变会导致许多疾病的产生,如神经退行性疾病、癌症、心脏病和糖尿病等。
线粒体蛋白质组学旨在从整体角度出发,分析线粒体的蛋白质组成、表达水平与修饰状态等的动态变化,阐明线粒体内全部蛋白质的表达模式和功能模式,以及蛋白质相互作用等,为解析线粒体的生理功能、探索线粒体相关疾病的发病机制及促进线粒体为靶向的药物研发提供重要理论依据。
 
技术流程:

技术流程
   
我们的技术优势:
高稳定蛋白提取方法:在主流提取(膜蛋白/线粒体/叶绿体/外泌体等)技术的基础上,优化了提取方案的上下游,使提取纯度在原有基础上增加10-20%,蛋白通量增加15%
高性能质谱系统:配备高性能质谱系统和SWATH全扫描采集方式,有效提升了对极低丰度的亚细胞相关蛋白的鉴定
多数据库整合:通过整合多个相关的高质量蛋白数据库,极大提高亚细胞蛋白定位准确度和通量
多维度数据分析:鉴定蛋白除了与更全的相关亚细胞数据库比较外,同时基于计算方法,使用多款软件进行亚细胞定位预测分析,进一步增加鉴定通量。
 
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